L’automate de préparation d’acides nucléiques
Le robot (Hamilton Robotics) installé sur le plateau d’ingénierie de souches haut débit de TWB permet la préparation automatisée d’acides nucléiques.
L’automate permet de réaliser
au format microplaque 96 puits des extractions et purifications d’acides nucléiques à partir de différents types de micro-organismes: ADN plasmidique, ADN génomique, purification de fragments d’ADN et purification d’ARN. L’automate permet d’utiliser
aussi bien les techniques d’adsorption sur gel de silice que les techniques d’immobilisation sur billes magnétiques. La zone de manipulation est protégée par flux laminaire (plafond soufflant équipé d’un filtre HEPA). L’automate est équipé de deux outils de pipetage, un bras de pipetage 8 pipettes à écartement variable et une tête de pipetage 96 canaux pipetant une
gamme de volume de 1µL à 1mL. Les modules installés sur le plan de travail du robot permettent de
paralléliser deux plaques 96 puits: deux stations sous-vide (filtration sur plaques filtrantes), deux supports magnétiques (extractions par immobilisation sur billes magnétiques), deux agitateurs pour microplaques et deux modules thermostatés (4-99°C).

Plusieurs
équipements complémentairesdu plateau ingénierie de souches haut-débit permettent
le contrôle qualité des acides nucléiques purifiés:
- Un spectrophotomètre UV-visible micro-volume multi-échantillons Nanodrop 8000 pour la mesure des concentrations par mesure d’absorbance
- Un système d’électrophorèse sur gel d’agarose pré-coulé 96 puits pour le contrôle qualité de l’ADN super enroulé
- Deux systèmes d’électrophorèse capillaire moyen débit (Bioanalyzer Agilent) et haut-débit (GXII Perkin Elmer) pour le contrôle qualité des ADN linéaires et l’évaluation de la qualité de l’ARN par RIN (RNA Integrity Number).
Ce type de robot est utilisé de façon courante pour plusieurs types d’applications et projets :
- Biologie synthétique, ingénierie génétique et métabolique, ingénierie de souche
- Evolution d’enzymes
- Expression de protéines
- Construction de banques.
La mise en service complète des protocoles standards de purification d’acides nucléiques est prévue en
juin 2016. D’autres protocoles pourront être développés à façon sur cette station en réponse à une demande spécifique.
Contact : Hélène Cordier, resp. du plateau Ingénierie de souches haut débit TWB, helene.cordier@insa-toulouse.fr