Ingénierie de souches

Les activités de la plateforme d’ingénierie de souches de TWB couvrent les axes d’ingénierie génétique-métabolique ainsi que de criblage phénotypique et fonctionnel des microorganismes.
Elle réunit des expertises en biologie moléculaire, biochimie, enzymologie, génétique et physiologie microbienne pour la miniaturisation et l’automatisation des expériences à haut-débit d’échantillons.
Performance
et précision
Grace à l’application de workflows standardisés, la plateforme facilite et accélère la génération et la caractérisation de variants biologiques tout en optimisant les délais expérimentaux et en garantissant la qualité des résultats.

Spécialité et expertise
Ingénierie génétique et métabolique de bactéries et de levures design in silico et analyse de séquences, préparation de banques d’ADN et assemblage combinatoire, mise en compétence et transformation cellulaire, production et purification de protéines à haut débit, tests d’activité enzymatique, détection et quantification de produits d’intérêt.
Dans une démarche d’optimisation des délai expérimentaux, plusieurs solutions robotisées peuvent être mis en œuvre :
- Operations de pipetage en conditions stériles ou sous aspiration chimique ;
- Techniquesde criblage phenotypique ;
- Extraction d’acides nucléiques ;
- Distribution de liquides en nanovolumes et sans contact pour limiter les couts consommables et les risques de contaminations
Ces équipements permettent une automatisation poussée, une réduction des temps expérimentaux et une optimisation des processus en biologie synthétique et ingénierie génétique.



Dispositifs expérimentaux
- Datamining, bioinformatique et analyse multi-omics
- Ingénierie génétique et construction de variants (châssis conventionnels et non conventionnels)
- Criblage à haut débit phénotypique et fonctionnel (production de protéines, activité enzymatique, biodiversité)
- Automatisation et robotique (workflows 96 / 384 puits)
- Miniaturisation et réactions en nanovolumes (workflows 384 / 1536 puits)
- Chaîne analytique et lecture en microplaques (activité, signal, croissance)
- Biologie moléculaire et caractérisation génétique (ADN/ARN)

Accès et accompagnement
L’accès à la plateforme s’accompagne d’un support scientifique et technique, incluant :
- la formation à l’utilisation de certains équipements,
- la mise à disposition d’outils expérimentaux,
- et un suivi adapté selon le cadre contractuel (prestation, collaboration R&D ou partenariat public-privé).
