L'équipe de Catalyse et Ingénierie Moléculaire Enzymatiques (CIME)

Nom de l’équipe

Mission

Découverte, design et ingénierie d’

pour les

et la

. Intégration dans des procédés enzymatiques ou des usines cellulaires pour la

.

Mots clés

Catalyse enzymatique, Relation structure-activité-dynamique, Métagénomique, Métatranscriptomique, Biologie computationnelle, Design et Ingénierie des protéines, Criblage haut débit, Bioraffineries, Lipotransformation, Sucro-transformation

Responsable

Magali REMAUD-SIMEON – Professeur INSA de Toulouse

– 05 61 55 94 46

Effectifs équipe : 68

 : 17 Enseignants et chercheurs  / 3 Ingénieurs  / 4 Assistants ingénieurs et techniciens

: 19 Post-doctorants / 14 Doctorants / 5 Ingénieurs /6 Assistants ingénieurs et techniciens

Axes thématiques

• Découverte de catalyseurs
• Etude des relations structure-fonction-dynamique et Ingénierie des enzymes
• Modélisation et Design d’enzymes
• Intégration d’enzymes en systèmes a-cellulaires et cellulaires

Sous-équipes

• Lipotransformation (A. Marty)
• Lignocellulases (M. O’Donohue)
• MetaOmics pour la découverte d’enzymes (G. Véronèse)
• Biologie computationnelle structurale (I. André)
• Sucrotransformation (M. Remaud-Simeon)

Modèles de recherche

Multiples glycoside hydrolases, transglycosylases (Family 13, 70, 32, 68, 62, 10, 11, 120, 130, 109, 129), Glycosyltransférases, Enzymes du métabolisme des lipides (Lipases, Désaturases, Fatty acyl synthases) Enzymes du métabolisme des acides aminés, protéases, oxydases, nitrilases

Domaines d’application et produits cibles

 : Alimentaire, Santé, Chimie fine, Cosmétique, Energie, Environnement, Bioraffinerie, Biotechnologie industrielle, Biologie de synthèse

 : Prébiotiques, Glycoconjugués, Biopolymères, Tensioactifs, Intermédiaires de synthèse, Biocarburants…

Technologies, techniques, outils spécifiques

Plateau « Ingénierie et Criblage d’Enzymes Optimisées » ICEO-PICT, équipé de robots de criblage, chromatographes analytiques, systèmes automatisés de purification de protéines et intégré à la « Plateforme Intégrée de Criblage de Toulouse » (PICT) offrant un accès privilégié à une infrastructure dédiée à la biophysique structurale.

Publications significatives

André I., Potocki-Véronèse, Barbe S., Moulis C. and Remaud-Siméon M. 2014. CAZyme discovery and design for sweet dreams. Curr. Opin. Chem. Biol. 19, 17-24 Duquesne S., Bozonnet S., Bordes F., Dumon C., O’Donohue M., Nicaud J.M., Marty A. 2014 Construction of a highly active xylanase displaying oleaginous yeast: Comparison of anchoring systems. Plos ONE in press Ladevèze S. , Tarquis L., Cecchini D.A., Bercovici J., André I., Topham C.M., Morel S., Laville E., Monsan P., Lombard V., Henrissat B., and Potocki-Véronèse G. 2013. Role of glycoside-phopshorylases in mannose foraging by human gut bacteria. J. Biol. Chem., 288:32370-32383. Siguier, B., Haon, M., Nahoum, V., Marcellin, M., Burlet-Schiltz, O., Coutinho, P. M., Henrissat, B., Mourey, L., Donohue, M. J. O., Berrin, J.-G., Tranier, S., and Dumon, C. (2014) First structural insights into  -L-arabinofuranosidases from the two GH62 glycoside hydrolase subfamilies. J. Biol. Chem., jbc.M113.528133 Traoré S., Allouche D., André I., de Givry S., Katsirelos G., Schiex T. and Barbe S. 2013. A New Framework for Computational Protein Design through Cost Function Network Optimization. Bioinformatics. 29(17), 2129-2136

Projets précompétitifs

– Modification à façon de flavonoïdes pour créer des composés à forte valeur ajoutée

– Synthèse chimio-enzymatique contrôlée de polymères biocompatibles pour la production d’architectures macromoléculaires complexes

– Nouvelle technique de « Yeast Display » pour la réalisation de bioprocédés consolidés innovants

– Ingénierie de Bacillus subtilis pour la surproduction de glucane-saccharases et glucopolymères