Physiologie intégrative et Génomique fonctionnelle de systèmes microbiens
Nom de l’équipe
Physiologie intégrative et Génomique fonctionnelle de systèmes microbiens
Sa mission
Compréhension de la régulation du métabolisme microbien et de son adaptation aux contraintes extrêmes, réorganisation du métabolisme (voies synthétiques) pour des applications biotechnologiques
Mots clés
Génomique fonctionnelle, régulation génétique et métabolique, paroi cellulaire, biologie intégrative, métabolisme synthétique, levures, champignons filamenteux
Responsable
Jean-Marie FRANCOIS – Professeur INSA de Toulouse – fran_jm@insa-toulouse.fr
Effectifs équipe en 2014 : 26
6 enseignants et chercheurs / 2 ingénieurs / 3 assistants ingénieurs et techniciens / 15 doctorants et post-doctorants
Axes thématiques
L’équipe est organisée en 3 axes :
- approche intégrative de la construction de la paroi des levures
- génomique fonctionnelle et régulation métabolique
- réorganisation du métabolisme et machinerie synthétique
Modèles de recherche
Levure Saccharomyces cerevisiae
Champignon filamenteux Talaromyces versatilis
Domaines d’application
Biotechnologies blanches, nutrition animale.
Produits cibles
Parois de levure comme probiotiques.
Levures à capacité fermentaire et / ou résistances aux conditions extrêmes améliorées.
Microorganismes avec nouvelles capacités métaboliques pour la production de synthons chimiques.
Technologies, techniques, outils spécifiques
Génétique et biologie moléculaire (levures, champignons filamenteux, bactéries)
PCR & qRT-PCR
Cytométrie en flux
Microdissection
Microscopie à épifluorescence
Méthodes d’extraction et analyse de exo et endo métabolome par GC-MS et LC-MS
Publications et brevets significatifs
- Walther, T., Novo, MA., Rossger, K., Letisse, F., Loret, M.O., Portais, JC. and François, J. (2010). Implication of the purine salvage pathway in the ATP homeostasis upon sudden transition from respiratory to fermentative growth conditions. Mol. Syst. Biol. 6: 344 -356.
- Teste, M.A., Francois, J.M. and Parrou, J.L. (2010) Characterization of a new multigenes family encoding isomaltases in the yeast Saccharomyces cerevisiae: the IMA family. J. Biol. Chem. 285, 26815 -26824.
- Walther, T., Mtimet, N., Alkim, C., Vax, A., Loret, M-A., Ullah, A.Z., Gancedo, G., Smits, G.J and François J. (2013) Metabolic phenotypes of Saccharomyces cerevisiae mutants with altered trehalose-6-phosphate dynamics. Biochem. J. 454: 227-237
- Pillet, F., Lemonier, S., Schiavone, M., Formosa, C., Martin-Yken, H., François, J. & Dague, E. (2014) Uncovering by Atomic Force Microscopy of an original circular structure at the yeast cell surface in response to heat shock. BMC Biology, 12:6
- Walther, T., Cordier, H., Topham, Ch., Andre, I., Remaud-Simeon, M., Huet, R. & François, J. A novel method of production of 2,4-dihydroxybutyric. published May 5th 2012 as WO2012/056318A1
Projets intermédiaires et précompétitifs
SYNTHACS (ANR –PIA) : Biologie synthétique pour la synthèse de molécules chimiques à haute valeur ajoutée à partir de ressources carbonées renouvelables
PENTOSYS – Développement d’une voie métabolique synthétique pour l’assimilation de nouvelles sources carbonées
ROBUST – Robust engineering of synthetic pathways through novel genome design
