Station automatisée d’ingénierie de souches
Le plateau haut-débit de TWB a développé un système robotique intégré dédié à l’automatisation des processus d’ingénierie de souches de micro-organismes.
La station est constituée d’un
automate de pipetage(StarPlus Hamilton Robotics), et d’une
extension intégrée. L’automate est équipé de deux outils de pipetage :
- un bras de pipetage 8 pipettes à écartement variable
- une tête de pipetage 96 canaux pipetant une gamme de volume de 1µL à 1mL.
Les modules installés sur le plan de travail du robot permettent de réaliser toutes les opérations de biologie moléculaire (modules thermostatés agitants, station de filtration sous vide). L’extension comprend :
- une réserve de consommable (stackers)
- une armoire thermostatée pour les échantillons biologiques entrant et sortant (Thermoscientific)
- un lecteur multimodes (Safas)
- une centrifugeuse microplaques (Agilent)
- un distributeur de réactifs (Biotek)
- une scelleuse (Fortitude)
- huit incubateurs microbiologiques indépendants (Inheco).
Un
bras robotiqueassure le transfert des plaques de l’extension à la zone de pipetage, et la distribution des plaques à l’ensemble des équipements intégrés. Toutes les zones de manipulation sont protégées par un
flux laminaire(plafonds soufflants équipés de filtres HEPA).
Le système est conçu de façon modulaire et nous développons une gamme de méthodes unitaires qui sont assemblées en fonction du projetpour construire un processus complet. Cette stratégie apporte la flexibilité alliée au débit dont nous avons besoin pour nous adapter à un grand nombre de projets. Sur cet outil nous développons des méthodes unitaires pour
l’ingénierie de souches et la biologie synthétique: plusieurs méthodes d’assemblage d’ADN (clonage), des outils d’édition des génomes par la méthode CRISPR-cas9, la transformation automatisée de plusieurs espèces de micro-organismes (
E. coli, S. cerevisiae, Y. lipolytica). Nous développons également des modules de
criblage des constructions: génotypage, tests d’activité enzymatique, mesures automatisées de fluorescence et bioluminescence, suivi des performances de croissance, optimisation de l’expression des protéines par criblage d’expression et purification par affinité de protéines recombinantes taguées au format microplaques. Le système combine la flexibilité qui nous permet de fournir des processus sur mesure pour différents micro-organismes, et le débit nécessaire pour augmenter la diversité qui peut être générée et criblée. Cette station est utilisée en combinaison avec les équipements complémentaires du plateau haut-débit pour plusieurs types d’applications et projets :
- Biologie synthétique, ingénierie génétique et métabolique, ingénierie de souche
- Construction de banques d’expression et de banques de mutagénèse
- Evolution d’enzymes
- Expression de protéines
